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理解分数:急性HIV感染的动态审讯

类别: 学院, 研究

教授亚历克斯shalek最近的工作已经强调了MGH,bt365手机和哈佛大学的ragon研究所的文章。

亚历克斯shalek,辉瑞劳巴克职业发展副教授ragon准会员,有一个新的 研究 今天发表在自然医学,超急性HIV-1感染过程中集成多免疫动力学的单细胞分析。本研究采用单细胞RNA测序来了解急性HIV感染后,免疫系统动力学,从新鲜提供的样品在南非,这是由ragon成员克里斯塔东润研究(通过培训,支持和健康上升女性)。研究生SAM kazer测序,并从四个HIV患者谁从非感染状态提供常见的临床样本,通过急性感染分析了59000电池,长达两年九个月后感染无需治疗。这些样品,照顾南非标准之前获得包括抗逆转录病毒疗法(ART)开始在艾滋病诊断,代表了一个独特的机会,仔细检查了免疫系统对急性HIV感染的反应。

使用单细胞的方法,以接管的很长一段时间的样品,shalek实验室能够识别瞬态转录变化是,合在一起,带动了免疫系统的动态和不断变化的响应急性HIV感染了两年多。本质上,他们已经审查了免疫反应,就好像它是一首交响曲;每个单元是一个工具,他们都彼此,有时不能,短暂或整个运动一起玩,有时和谐,创造更大的免疫反应。听力交响乐相对容易;听到每个单独的音符每个单元的往往是困难得多。

要做到这一点,实验室开发了一种新的框架,将允许在单细胞水平的免疫应答的审讯。这提供了深入洞察身体的反应急性HIV感染,通过观察动态的细胞反应,单独和协同工作,随着时间的推移。如果你愿意,他们是交响乐的每一个瞬间分解成单个的仪器和正在弹奏的音符来决定文书如何 - 在这里,细胞 - 共同创造更大的免疫反应。就像一首交响乐,某些时刻是令人难以置信的短暂的,可能更难区分,但必须到整体。该框架允许shalek实验室解剖每个单个细胞的部分级别的响应。使用单细胞RNA测序随着时间的推移,他们可以看到角色的每个细胞都需要打怎么样,或者如果它进行交互(和谐)与其它细胞 - 免疫反应急性HIV感染的动态。

结果表明,在急性感染的免疫细胞的新角色,其中包括自然杀伤细胞,单核细胞和CD4+ T细胞,以及成为推动跨越多个患者识别的免疫系统的反应“程序”识别的遗传变化。此外,两名患者是潜在的控制器,其感染艾滋病毒的研究过程中没有取得进展,尽管他们不是对艺术的事实。在这些患者中,增殖,细胞毒性自然杀伤细胞的亚急性感染的最初阶段被确定,这表明对感染的第一个反应可能会影响免疫系统的能力,以控制艾滋病病毒长期。

最终,这项工作提供了急性HIV的免疫反应的一个重要的,独特的参考集。新开发的框架超越了艾滋病病毒,但是,它可以被用于询问免疫应答两者细菌和病毒感染的动力学,并且可以是在非感染性疾病,如癌症或自身免疫性病症的使用。